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Moteur de recherche d'offres d'emploi CEA

CDD INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE TRAITEMENT DONNEES METABOLOMIQUES H/F


Détail de l'offre

Informations générales

Entité de rattachement

Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.

Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).

Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.  

Référence

2021-17851  

Description de la Direction

Le Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI) de l'Institut JOLIOT (DRF) recherche un/une CDD Ingénieur(e) en bio-informatique spécialisé(e) dans le traitement des données métabolomiques.

Description de l'unité

Vous serez accueilli(e) au sein du laboratoire d'Immuno-Allergie Alimentaire d'Immunoanalyse (SPI ; UMR CEAINRAE-Univ Paris Saclay)

Description du poste

Domaine

Chimie

Contrat

CDD

Intitulé de l'offre

CDD INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE TRAITEMENT DONNEES METABOLOMIQUES H/F

Statut du poste

Cadre

Durée du contrat (en mois)

12 mois, éventuellement renouvelable 6 mois

Description de l'offre

Dans le cadre d’analyse de cohortes Mère-Enfant, différents types d’échantillons (lait, méconium) ont été analysés au sein du laboratoire au moyen de méthodes de chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse Haute Résolution (LC-HRMS). Des approches non ciblées de métabolomique, glycomique et lipidomique ont ainsi été menées en parallèle sur ces échantillons, générant de grandes quantités de données.

L’ingénieur(e) recherché(e) aura pour mission d’optimiser tout le processus de prétraitement de ces données LC-HRMS, en fonction des questions scientifiques posées. Il s’appuiera sur les différents workflows et outils disponibles au sein de la plateforme nationale MetaboHUB (W4M), ou développés en interne par l’équipe Science des Données. Il devra interagir avec toutes les équipes du laboratoire pour s’assurer du bon traitement des différentes données (paramétrisation des worflows, contrôle qualité sur les résultats), et de leur qualité et pertinence, et sera force de proposition pour améliorer ces outils. La plupart des développements informatiques au sein du laboratoire étant basée sur le logiciel R, il devra avoir de bonnes bases en R.

Profil du candidat

La personne recrutée devra être motivée, autonome, avoir une bonne connaissance en gestion de projet (organisation, planification, livrables, archivage...), et savoir s’intégrer dans un collectif aux compétences variées.

De formation Chimie Analytique orientée méthodes omiques en association avec des connaissances solides en bioinformatique et biostatistique, le/la candidat(e) devra donc présenter :

·         Une expérience en analyse de données Omiques

·         Un bon niveau de programmation en R

·         De solides compétences en statistiques univariées et multivariées (ACP, PLS, PLSDA, Clustering… )

·         Un bon niveau d’anglais scientifique

·         Une organisation rigoureuse

Des connaissances générales en biologie seraient un plus.

Rémunération selon diplôme et expériences professionnelles. Première expérience bienvenue.

 

Date limite de candidature : 5 septembre 2021 (CV + lettre de motivation + lettres de recommandation).

Localisation du poste

Site

Saclay

Localisation du poste

France, Ile-de-France, Essonne (91)

Ville

Saclay

Critères candidat

Langues

Anglais (Courant)

Formation recommandée

BAC+5

Demandeur

Disponibilité du poste

15/10/2021