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Moteur de recherche d'offres d'emploi CEA

Ingénieur Bio-Analyse H/F


Détail de l'offre

Informations générales

Entité de rattachement

Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.

Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).

Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.  

Référence

2019-9107  

Description de la Direction

Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.

Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration.

Description de l'unité

L'Institut de biologie François-Jacob à Evry regroupe les départements du Genoscope et du CNRGH. Ces départements allient une activité de production de données à haut-débit pour des projets collaboratifs hautement compétitifs et des projets de recherche propres.
Le CNRGH a comme objectif principal de faire avancer la recherche en génomique des maladies humaines.

Il comporte un laboratoire de bio-analyse qui travaille sur des données issues de différentes approches de séquençage à haut-débit de types variés (transcriptomique, SNVs, INDELs, variants structuraux, Hi-C, méthylation, etc.).

Le laboratoire de bio-analyse mène des projets avec des collaborateurs internes au CNRGH ou externes (CEA, Inserm, CNRS), ainsi que des projets propres au laboratoire.
Il dispose de sa propre infrastructure de calcul et a aussi un accès privilégié au clusters de calcul du CEA.

Description du poste

Domaine

Biologie, biophysique et biochimie

Contrat

CDI

Intitulé de l'offre

Ingénieur Bio-Analyse H/F

Statut du poste

Cadre

Description de l'offre

Vous analyserez des données de types NGS correspondant à des problématiques biologiques variées, qui peuvent parfois intégrer différents niveaux (multi-omics). Vous prenez en charge les données brutes de séquençage et vous définissez avec les collaborateurs les différentes analyses à mener. Vous choisissez les meilleurs outils bioinformatiques en fonction de l'état de l'art et vous les mettez en œuvre en écrivant des scripts et en utilisant le cluster de calcul.
Vous définissez aussi les analyses statistiques à faire, présentez vos résultats aux collaborateurs et définissez les nouveaux cycles d'analyses.
Vous pouvez aussi contribuer à la rédaction de publications scientifiques et participer à des congrès scientifiques nationaux ou internationaux.

Profil du candidat

De formation bioinformatique ou ingénieur, vous êtes titulaire d'un doctorat avec une expérience significative (une ou plusieurs publications dans des revues à comité de lecture) dans le domaine des analyses et interprétation de données NGS. Vous êtes à l'aise pour l'écriture de scripts (R, Bioconductor, python) en environnement Linux. Vous avez aussi une expérience de l'utilisation de clusters de calcul (scheduler de type SLURM, par exemple). Vous avez des connaissances des mécanismes moléculaires fondamentaux impliqués dans les maladies humaines, telles que le cancer ou les maladies génétiques. Vous aimez la communication et l'interaction avec les biologistes.

Localisation du poste

Site

Autre

Localisation du poste

France, Ile-de-France

Ville

2 Rue Gaston Crémieux, 91000 Évry

Critères candidat

Formation recommandée

Doctorat en Bioinformatique ou équivalent/ Diplôme d'ingénieur/ Master avec expérience démontrable

Demandeur

Disponibilité du poste

15/05/2019