Informations générales
Entité de rattachement
Le CEA est un acteur majeur de la recherche, au service des citoyens, de l'économie et de l'Etat.
Il apporte des solutions concrètes à leurs besoins dans quatre domaines principaux : transition énergétique, transition numérique, technologies pour la médecine du futur, défense et sécurité sur un socle de recherche fondamentale. Le CEA s'engage depuis plus de 75 ans au service de la souveraineté scientifique, technologique et industrielle de la France et de l'Europe pour un présent et un avenir mieux maîtrisés et plus sûrs.
Implanté au cœur des territoires équipés de très grandes infrastructures de recherche, le CEA dispose d'un large éventail de partenaires académiques et industriels en France, en Europe et à l'international.
Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :
• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité
Référence
2026-39634
Description de la Direction
La Direction de la Recherche Fondamentale (DRF) du CEA réunit plus de 5000 personnes sur quatre sites et mène des recherches en sciences physiques, chimiques, biologiques et environnementales, en utilisant des technologies de pointe.
Description de l'unité
Implanté sur le site d'Évry, l'Institut JACOB s'inscrit pleinement dans la stratégie scientifique de la DRF au travers des activités l'UMR 8030 Génomique Métabolique, structure de recherche fondamentale du Genoscope (centre national de séquençage). En particulier, les activités scientifiques du laboratoire LABGeM sont centrées sur l'analyse bioinformatique des (méta)génomes microbiens (dynamique et évolution des génomes bactériens, annotation fonctionnelle des (méta)génomes, analyse du métabolisme) et le développement de méthodes innovantes en pangénomique microbienne.
Le projet PanGAIMIX, financé dans le cadre d'un appel à projets ANR PRC, vise à développer de nouvelles méthodes bioinformatiques appliquées aux génomes microbiens afin de mettre en évidence des schémas évolutifs complexes et d'améliorer notre compréhension du fonctionnement des communautés microbiennes. Ce projet est mené en collaboration avec les équipes MalAGE de l'INRAE et LaMME de l'Université d'Évry. Un des objectifs du projet est de développer un grand modèle de langage pour inférer des fonctions et prédire des processus biologiques, tels que des voies métaboliques ou des systèmes de défense.
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
CDD
Intitulé de l'offre
Ingénieur-chercheur en bioinformatique pour le Développement d'un modèle de langage pour les génomes H/F
Statut du poste
Cadre
Durée du contrat (en mois)
24
Description de l'offre
Vous êtes une personne passionnée par la génomique et l’intelligence artificielle et souhaitez contribuer à l'excellence de la recherche scientifique ?
Rejoignez-nous en tant que ingénieur-chercheur pour un CDD de 24 mois et participez au projet de recherche PanGAIMiX au sein de l’Institut JACOB !
🛠️ Vos missions
En tant que ingénieur chercheur, vos missions sont :
- développer un modèle de langage multimodal de type Transformeur pour les génomes microbiens en structurant les génomes en séquences de descripteurs fonctionnels
- valider l e modèle e n optimisant son architecture et sa stratégie d'entraînement, puis en évaluant ses performances à l'aide d e métriques biologiquement pertinentes
- exploiter le modèle pour la prédiction t le design biologique en déployant des approches d'interrogation ciblée et d'ajustement fin du modèle dédiées l'inférence fonctionnelle
Profil du candidat
Vous êtes titulaire d’une thèse en informatique ou en bioinformatique avec une expérience en application de méthodes d’intelligence artificielle sur des données de génomique.
🧠 Compétences techniques et comportementales
· Expertise sur l’application de méthodes d’intelligence artificielle en génomique
· Expertise en algorithmes bioinformatiques et en développement logiciel.
· Solides compétences en programmation Python.
· Bonnes connaissances en génomique microbienne et en statistiques.
De solides compétences en communication et en organisation, une aptitude à travailler en équipe, une grande autonomie et une bonne maîtrise de l'anglais sont requises.
Localisation du poste
Site
Autre
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Essonne (91)
Ville
EVRY
Demandeur
Disponibilité du poste
01/04/2026