Vous êtes une personne passionnée par la recherche en métabolomique et souhaitez contribuer à l'excellence de la recherche scientifique ? Rejoignez nous pour un stage de 6 mois au sein de l'Institut JACOB !

Contexte :
Le diméthylsulfoniopropionate (DMSP) est l’un des composés organosulfurés les plus abondants de la planète : un milliard de tonnes par an sont produits dans l’océan. Précurseur du diméthylsulfure (DMS), principal flux naturel de soufre vers l’atmosphère et molécule à impact climatique, il établit un lien entre les processus biologiques marins et la régulation du climat. Chez les bactéries marines, deux voies cataboliques assurent sa dégradation : la voie de clivage, qui libère du DMS, et la voie de déméthylation, qui fournit du soufre cellulaire via le méthanethiol. Considéré comme exclusivement marin, le catabolisme du DMSP pourrait aussi se produire dans les sols, puisque toutes les plantes terrestres en forment. Les écosystèmes associés aux végétaux terrestres devraient donc héberger des micro-organismes capables de dégrader ce métabolite. Ceux-ci, s’ils étaient identifiés, pourraient conduire à une vision renouvelée du devenir planétaire du DMSP.

Les enzymes d’intérêt appartiennent à la famille des two-component flavin-dependent monooxygenases. Les gènes correspondants ont été clonés pour expression recombinante chez E. coli, et les protéines ont été purifiées par FPLC.

Le stage consistera en trois parties:

1) Cribler par LC-MS/MS ou GC-MS/MS l’activité des enzymes envers les différents catabolites du DMSP.

2) Caractériser cinétiquement les enzymes les plus actives.

3) Vérifier par une approche métabolomique (LC-MS/MS ou GC-MS/MS) que l’accumulation intracellulaire des produits des réactions enzymatiques testées est bien modifiée chez les mutants correspondants et évaluer l’impact des mutations sur le taux de croissance des cellules.

Ces données préciseront la fonction de ces gènes et compléteront la connaissance du catabolisme du DMSP chez ADP1, ouvrant la voie à l’évaluation de la contribution du catabolisme terrestre du DMSP au cycle global du soufre.

Merci d’envoyer votre candidature à Mr Perret : aperret@genoscope.cns.fr et Mme PERCHAT : demange@genoscope.cns.fr

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Vous faites preuve de rigueur, d'un bon sens de l'analyse, d'esprit d'équipe et d'autonomie. Vous maitrisez les logiciels de bureautique (Word, Excel) et rédigez avec aisance.

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Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés