Depuis une dizaine d’années, « filmer les protéines en action » à résolution atomique, est devenu possible grâce au développement de la cristallographie sérielle résolue en temps dans les lasers à électrons libres X (XFELs). Ces très grandes installations de recherche produisent des impulsions ultra-courts (de l’ordre de quelques dizaines de femtosecondes) d’une brillance de 10 ordres de grandeur plus élevée par rapport aux synchrotrons, autorisant la conduite d’expériences résolues en temps sur des échelles allant de la femtoseconde à la seconde, et la résolution de structure à partir de nano-cristaux.

Le groupe DYNAMOP a été pionnier en France dans l’utilisation des XFELs en biologie structurale, contribuant de façon séminale à l’avancement de l’état de l’art en microcristallographie résolue en temps, en nanocristallographie in vivo, en diffusion aux petits angles résolues en temps et en traitement de données.

C’est ainsi le premier groupe français capable de maîtriser l’ensemble des étapes clefs et complexes nécessaires au succès d’une expérience de cristallographie sérielle résolue en temps dans les XFELs. L’enjeu actuel du groupe DYNAMOP est de consolider et d’étendre son rôle de leader national et international dans les domaines sus cités en renforçant ses capacités et son expertise de traitement de données. Ce dernier, qui seul permet l’interprétation des données cristallographiques collectées aux XFEL en termes de structure tridimensionnelle d’une protéine en action, est en effet central au succès d’une expérience de cristallographie sérielle.

Le/ la chercheur(e) recruté(e) aura pour mission :

• d’assurer le traitement, l’analyse et l’interprétation de données de cristallographie sérielle aux rayons X – incluant l’indexation, l’intégration et la moyennation des intensités diffractées ;
• de l’extrapolation et la pondération de facteurs de structure ;
• et l’affinement des structures d’états intermédiaires de réaction des protéines en action.

Elle/il participera aux développements des logiciels du groupe, visant à optimiser, accélérer et améliorer le traitement de données de cristallographie sérielle et l’exploitation de l’information qu’elles contiennent. Dans ce contexte, la personne recrutée devra être familière avec le langage Python, ou équivalent, afin de pouvoir contribuer efficacement, et dès son recrutement, à ces efforts du groupe. La connaissance, voire la maîtrise d’un langage de programmation supplémentaire (par ex. le C++) sera considérée comme un atout.

Elle/il se déplacera une à deux fois par an pour participer aux expériences du groupe aux XFELs en Allemagne, en Suisse, aux Etats-Unis, en Corée du Sud ou au Japon. Enfin, il/elle participera aux expériences de cristallographie sérielle du groupe DYNAMOP au synchrotron ESRF à Grenoble.

Le candidat est également encouragé à développer sa propre ligne de recherche en accord avec les projets et la stratégie scientifique du groupe DYNAMOP.

Formation : Titulaire d’un doctorat en physique / chimie / biologie, avec une formation en cristallographie aux rayons X de macromolécules biologiques et une connaissance solide de la programmation, notamment dans le langage Python ou équivalent.

Compétences :

• Traitement de données de cristallographie sérielle (rayons X, électrons) et affinement de structure des macromolécules biologiques,
• Programmation dans le langage Python ou équivalent,
• Biochimie et cristallisation des protéines,
• Très bon niveau en anglais lu, parlé et écrit.

Expériences :

• Plusieurs années d’expérience en cristallographie macromoléculaire aux rayons X, et en cristallographie sérielle en particulier.
• Postdoctorat à l’étranger ou dans une installation internationale en France.
• Participation à des campagnes de mesure de cristallographie aux rayons X aux synchrotrons et/ou aux XFELs.
• Une thèse ou un postdoctorat effectué au sein d’un synchrotron ou d’un XFEL est un plus.

 Savoir être :

• Excellent sens de la communication
• Initiative et autonomie
• Esprit d’équipe
• Volonté d’intégration dans de larges consortia internationaux 

Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes en situation de handicap, cet emploi est ouvert à tous et à toutes.

Pour toute demande de renseignements sur le poste et les modalités de candidature, veuillez contacter le responsable du groupe DYNAMOP : Martin WEIK - Martin.WEIK@cea.fr 

Pour candidater, merci d'envoyer votre CV, lettre de motivation, liste de publications et références. Date limite de candidature : 31/04/2023