Le programme ATLASea est l'un des lauréats des programmes exploratoires PEPR, qui ciblent des secteurs scientifiques ou technologiques émergents où le gouvernement français voit la nécessité d'identifier et de structurer des communautés. Co-dirigé par le CNRS et le CEA, le programme ATLASea vise à séquencer les génomes de 4 500 espèces marines, avec la plupart des espèces provenant de la France métropolitaine, mais incluant également des espèces des territoires d'outre-mer.

En tant que chercheur en génomique, vous jouerez un rôle essentiel dans l'avancement de notre compréhension de la diversité génétique et des relations évolutives entre les espèces, telles que les interactions symbiotiques. Votre travail consistera à exploiter les génomes complets obtenus dans le cadre du programme ATLASea et plus généralement du projet EBP, en utilisant des techniques de pointe (telles que des méthodes basées sur l'IA) pour approfondir les études comparatives au niveau génomique.

Dans ce rôle, non seulement vous analyserez et interpréterez les relations évolutives symbiotiques à partir de génomes complets extraits d'échantillons environnementaux, mais vous intégrerez également ces résultats avec des données métagénomiques des projets Tara Ocean. Ce faisant, vous contribuerez à une compréhension holistique des écosystèmes marins et de leurs paysages génomiques complexes.

Vos responsabilités s'étendront au-delà de l'analyse pour inclure la supervision du développement d'outils informatiques et de pipelines, assurant l'analyse efficace et précise de grands ensembles de données génomiques.

De plus, vous jouerez un rôle clé dans le partage de nos résultats de recherche avec la communauté scientifique. Cela implique de contribuer à des publications dans des revues à comité de lecture et de présenter les résultats lors de conférences scientifiques, favorisant ainsi la collaboration et l'échange de connaissances.

En tant que membre du laboratoire, vous resterez à la pointe des avancées en génomique, génomique comparative et domaines connexes. Votre engagement à rester informé des derniers développements jouera un rôle crucial dans la définition de nos stratégies de recherche.

Le CEA est un acteur engagé dans l’accueil l’insertion et le maintien dans l’emploi des salariés en situation de handicap

Toutes les candidatures doivent être adressées à job-lbgb@genoscope.cns.fr et inclure :

●     Une lettre de motivation

●     Un CV complet avec vos coordonnées

●     Les noms et coordonnées d'au moins deux références

Les qualifications attendus pour le poste sont les suivantes :

●    Doctorat en génomique, bioinformatique, génétique ou domaine connexe avec un fort intérêt pour la génomique comparative et la biologie évolutive

●     Expérience avérée dans l’analyse de génomes complets et de haute qualité

●     Maîtrise des outils bioinformatiques et des langages de programmation couramment utilisés en recherche en génomique (par exemple, Python, R et les packages logiciels pertinents). Une expertise dans l'utilisation de clusters informatiques haute performance et de grilles de calcul est un plus

●     Un fort intérêt pour les méthodes basées sur l'IA serait également un avantage, en particulier dans le domaine de la génomique.

●     Excellentes compétences en communication et capacité à travailler de manière collaborative dans un environnement orienté vers l'équipe