Rattaché(e) aux responsables de la plateforme de BioInformatique Intégrative (BIOI2), vous travaillerez en étroite collaboration avec les autres membres du service informatique pour mettre au point des solutions techniques permettant l'analyse et la diffusion des données, tout en étant attentif(ve) aux aspects de performances, d’évolution et de maintenance des solutions proposées.

Vous renforcerez l’équipe pour permettre l’essor de nouvelles technologies en bioinformatique s’appuyant de façon croissante sur les technologies d’apprentissage profond et d’intelligence artificielle.

Vous collaborerez étroitement avec les plateformes d’imagerie, de biologie structurale, de protéomique et de génomique de l’I2BC afin de les aider à élaborer des processus d’analyse utilisant les méthodologies les plus efficaces.

Avec ces plateformes, vous participerez à la veille technologique et pourrez à ce titre vous intégrer aux réseaux nationaux dans lesquelles elles échangent des solutions technologiques.

Vous serez chargé(e) de mettre en place des outils permettant aux utilisateurs des plateformes technologiques de l’I2BC de traiter leurs données brutes, d’effectuer calculs et simulations nécessaires à l’interprétation de ces données en favorisant leur intégration pour différentes échelles d’analyse.

Vous participerez à promouvoir l’activité de la plateforme BIOI2 à l’échelle nationale en vous impliquant dans des actions de formation à l’IFB et de transmission de ses expertises. Un objectif important de votre activité sera d’apporter une assistance pour le déploiement de solutions utilisant les méthodologies d’apprentissage et d’intelligence artificielle. Il pourra typiquement s’agir d’optimiser les paramètres d'un modèle d'IA pré-entraîné afin d'améliorer ses performances pour une tâche spécifique. Les champs d’applications pourront aller de l’optimisation de réseaux de reconnaissance d’images pour le traitement des données de microscopie électronique à la spécialisation de grands modèles de langage pour l’ingénierie des protéines.

Vous devrez interagir en synergie avec les autres informaticiens en charge de ces questions, ce qui favorisera l’essor d’une expertise de haut niveau au sein de l’Institut tournée vers les développements prometteurs en intelligence artificielle et en biologie prédictive.

Ingénieur(e) en informatique avec une spécialisation en sciences des données et en intelligence artificielle et/ou possédant un doctorat dans un domaine de la bioinformatique avec une expérience en méthodes d’apprentissage, vous bénéficiez, par exemple, d’une expertise en traitement d’image pour la microscopie ou en modélisation intégrative.

Vous maîtrisez linux et python, avez une connaissance des librairies de machine learning et deep learning, et de l’utilisation des ressources de calcul intensif sur environnements CPU et GPU. 

Vous devrez, si possible, posséder des connaissances dans le domaine de la biologie qui vous permettront de mieux comprendre les besoins exprimés.

Possédant de grandes qualités d’écoute, vous serez sera amené(e) à interagir fréquemment avec les ingénieur(e)s des autres plateformes pour imaginer des solutions techniques permettant d’exploiter au mieux les données générées à haut débit.

La rigueur, le sens de l’organisation et la réactivité seront des atouts particulièrement appréciés.

Le sens du service et les qualités techniques et humaines au profit de l’accompagnement des communautés scientifiques dans leur utilisation optimale de systèmes de calcul feront partie des critères importants de l’évaluation des candidats.

Dossier de candidature : CV, lettre de motivation et lettres de recommandation

A envoyer à direction@i2bc.paris-saclay.fr avant le 28/06/2024.