Informations générales
Entité de rattachement
Le Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) est un organisme public de recherche.
Acteur majeur de la recherche, du développement et de l'innovation, le CEA intervient dans le cadre de ses quatre missions :
. la défense et la sécurité
. l'énergie nucléaire (fission et fusion)
. la recherche technologique pour l'industrie
. la recherche fondamentale (sciences de la matière et sciences de la vie).
Avec ses 16000 salariés -techniciens, ingénieurs, chercheurs, et personnel en soutien à la recherche- le CEA participe à de nombreux projets de collaboration aux côtés de ses partenaires académiques et industriels.
Référence
2023-25479
Description de la Direction
Le Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) permet de répondre aux questions scientifiques nécessitant des besoins de séquençage et de génotypage à haut débit grâce au développement et à la mise en œuvre de technologies innovantes et intégrées. L'organisation du CNRGH permet d'optimiser la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines, en créant les liens indispensables entre la constitution de cohortes, l'identification de gènes responsables de maladies, l'étude du transcriptome et de l'épigénome.
Description de l'unité
Le poste est à pourvoir sur le site d'Evry, au sein du Laboratoire de Bio-Analyse sous la direction de Kevin MURET, Ingénieur-Chercheur en charge du projet et Eric BONNET, chef du laboratoire.
Description du poste
Domaine
Biologie, biophysique et biochimie
Contrat
CDD
Intitulé de l'offre
Ingénieur.e bioinformatique H/F
Statut du poste
Cadre
Durée du contrat (en mois)
6 mois
Description de l'offre
Mission principale : Mise en place d’un nouveau pipeline d’analyse de variants
Dans le cadre du projet ANR HF-HS porté par le Laboratoire d’Immunologie de l’IMRB (Institut Mondor de Recherche Biomédicale), le CNRGH apporte son expertise dans l’analyse de données de séquençage. Souhaitant standardiser un nouveau pipeline permettant une analyse fine de données WES (Whole-Exome Sequencing), vous prendrez en main les outils mis à votre disposition pour les modulariser sous Nextflow.
Vous travaillerez en étroite collaboration avec les ingénieurs-chercheurs des laboratoires de bio‑analyse, bio-informatique et Math-Stats du CNRGH.
Possibilité de télétravail de 2 à 3 jours par semaine.
Rémunération selon qualification et expérience.
Les dossiers de candidature (curriculum vitae, lettre de motivation) sont à adresser directement à Kévin MURET (kmuret@cnrgh.fr) avant fin mars.
Profil du candidat
Savoir-faire
· Connaissances des langages de programmation : bash / R
· Travail dans un environnement unix
· Maîtrise d’un cluster de calcul
· Utilisation de gestionnaire de workflow
· Optimisation des ressources
Savoir-être
Nous cherchons une personne rigoureuse, autonome, dynamique, à l’écoute, avec un bon sens du relationnel.
Localisation du poste
Site
Fontenay-aux-Roses
Localisation du poste
France, Ile-de-France, Essonne (91)
Ville
Evry
Critères candidat
Formation recommandée
Bac+5 bioinformatique
Demandeur
Disponibilité du poste
01/06/2023
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